Genómica y biología fúngica
Acceso abierto

abstracto

Ganoderma lucidum modula la proteómica citoesquelética neuronal distorsionada y la interacción proteína-proteína en animales modelo de la enfermedad de Alzheimer

Mohammad Azizur Rahman, Shahdat Hossain, Noorlidah Abdullah, Norhaniza Aminudin

Antecedentes: La enfermedad de Alzheimer (EA) es el principal trastorno neurodegenerativo que afecta la memoria, el aprendizaje y la comportamiento. La expresión alterada de proteínas involucradas en la estructura y función neuronal es una observación reciente de la EA Patogénesis. La modulación de la expresión alterada de proteínas parece prometedora en la terapéutica de la EA. En el presente experimento, el efecto de mejora de AD del hongo medicinal Ganoderma lucidum (GL) había sido evaluado a través de su efecto sobre la estructura del citoesqueleto neuronal y el patrón de expresión de proteínas relacionado con la función en ratas modelo AD.

Métodos: Ratas Wistar macho (120 ± 5 g) se dividieron en tres grupos: rata de control (CR), modelo de enfermedad de Alzheimer Rata (ADMR) y G. lucidum Extracto de agua caliente (GHWE) alimentado con ADMR, cada grupo con 15 ratas. AD modelo de ratas se prepararon infundiendo Aβ1-42 (ab120959, abcam, EE. UU.) en los ventrículos cerebrales. Extracción de proteínas de la muestras de cerebro se realizó después de la homogeneización del hipocampo (50 mg) con tampón de lisis (1 ml) utilizando un homogeneizador (Polytron PT 1200, Kinematica). Separación de proteínas mediante SDS-PAGE y cuantificación de proteínas a través de LC-chip MS/MS Q-TOF se había realizado para la cuantificación relativa sin etiquetas. Para los análisis estadísticos, el Los datos se exportaron al software Mass Profiler Professional (MPP) y se realizó ANOVA (P<0.05) para superar las complicaciones del falso descubrimiento asociado con múltiples análisis de prueba. Redes de interacción funcional de las proteínas se identificaron utilizando STRING (herramienta de búsqueda para la recuperación de genes/proteínas que interactúan) base de datos (versión 10.0; http://string-db.org/). Para una mayor identificación de vías de sobrerrepresentación y biológicos funciones, Ingenuity Pathway Analysis (IPA), versión de compilación: 389077M, versión de contenido: 27821452, (Fecha de lanzamiento: 2016-06-14) (https://www.ingenuity.com/wp-content/themes/ingenuity-qiagen). Conjuntos de datos de las proteínas. expresaron significativamente (P<0.05) y se cargaron log FC (fold change) de 1.5 y más (ADMR versus CR, ADMR frente a ADMR alimentado con GHWE y CR frente a ADMR alimentado con GHWE).

Resultados: Entre las 2212 proteínas identificadas en el presente estudio, se encontró que 819 se expresaban diferencialmente. De las expresadas diferencialmente, 9 proteínas se han relacionado con la estructura y función del citoesqueleto neuronal regulación tales como tubulina, β-actina, proteína 2 relacionada con la dihidropirimidinasa (DRP-2), queratina, ácido fibrilar glial Proteína (GFAP), proteínas Rho A, septina, cofilina, gelsolina y dinamina. Las ratas AD manifestaron expresión alterada de proteínas asociadas con la estructura y función neuronal. G. lucidum El tratamiento con agua caliente mejoró la alteración expresión de esas proteínas.

Conclusión: La expresión alterada de las proteínas del hipocampo es un sello distintivo de la EA. Enfoque regulatorio de la neuroproteómica hacia la mejora de AD parece prometedor. Inclusión de G. lucidum para la terapéutica de AD basada en proteómica en la regulación de las proteínas involucradas en la estructura y función neuronal parecen aptas. Así, G. lucidum podría considerarse como una AD especies de agentes terapéuticos.