Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Precipitación fraccionada de proteoma plasmático por sulfato de amonio: estudios de casos de leucemia y talasemia

Sutapa Saha, Suchismita Halder, Dipankar Bhattacharya, Debasis Banerjee y Abhijit Chakrabarti

El proteoma plasmático humano es una fuente completa de biomarcadores de enfermedades. Sin embargo, el rango de concentración dinámica de >10 órdenes de ancho de sus proteínas constituyentes requiere el agotamiento de abundantes proteínas del plasma antes del descubrimiento de biomarcadores. Nuestro objetivo ha sido desarrollar un método simple que agote las proteínas más abundantes, p. albúmina e inmunoglobulinas, facilitando de forma eficaz la identificación de proteínas diferencialmente reguladas en muestras de plasma. Empleamos un prefraccionamiento de plasma basado en sulfato de amonio seguido de electroforesis en gel bidimensional (2DGE) para comparar las proteínas normales con las de las muestras de plasma de los pacientes, después de la identificación de las proteínas mediante espectrometría de masas en tándem MALDI-TOF/TOF. La precipitación fraccionada de las muestras de plasma con sulfato de amonio al 20 % del plasma sin procesar duplicó el número de manchas de proteína después de 2DGE y condujo a la identificación de 87 proteínas únicas, incluidas varias proteínas de baja abundancia. Estudios de casos realizados con precipitación fraccionada de muestras de plasma de pacientes que padecen enfermedades hematológicas, p. la leucemia y la talasemia indican la utilidad de dicho fraccionamiento previo en la detección de proteínas reguladas diferencialmente.