Revista de Ciencias Teóricas y Computacionales
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abstracto

Expansión del repertorio de genes de micro ARN humano en el linaje humano después de la divergencia de los monos del Viejo Mundo y del Nuevo Mundo

Reiko F. Kikuno

Se ha postulado ampliamente que los micro ARN (miARN) han jugado un papel importante en lograr la complejidad morfológica durante el curso de la evolución de los eumetazoos, porque el repertorio de miARN ha aumentado continuamente junto con una mayor complejidad en los genomas de bilaterianos y vertebrados. En particular, el repertorio de miRNA se expande dramáticamente en humanos. Para examinar cómo cambiaron los miARN durante el proceso de evolución de los primates, estimamos los orígenes evolutivos de 1527 miARN humanos presentes a lo largo del linaje humano, después de la divergencia de los mamíferos euterios. Construimos un perfil evolutivo de los genes de miARN, basado en la presencia y ausencia de los ortólogos funcionales conocidos y previstos en seis especies de primates no humanos: chimpancé, gorila, orangután, gibón, macaco y tití y tres mamíferos euterios representativos: bovino , perro y ratón. Los ortólogos funcionales se predijeron mediante múltiples alineaciones de secuencias genómicas y búsquedas BLAST, seguidas de cuatro pasos de filtrado. El número de genes de miARN y familias de genes se expandió drásticamente en el linaje del mono del viejo mundo, después de la divergencia del ancestro común con el mono del nuevo mundo, a tasas aproximadamente siete veces más altas que en la etapa anterior de la evolución de los primates. Las tasas de expansión de miARN y familias de genes se han reducido ligeramente en los homínidos. Las comparaciones del número de genes con el de las familias de genes adquiridas en cada período evolutivo sugirieron que la generación de genes de novo, en lugar de la duplicación de genes, contribuyó considerablemente a la generación de nuevos genes de miARN.