Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Análisis evolutivo de CRISPR en Archaea: una evidencia de horizontal Transferencia de genes

Anupama S, Aswathy Rajan MP, Gurusaran M, Radha P, Dinesh Kumar KS, Chitra R, Hima Vyshanavi AM y Sekar K

Al igual que el sistema inmunitario eucariótico, los procariotas albergan CRISPR, una serie de espaciadores y repeticiones directas de ADN para fomentar la inmunidad contra los fagos y plásmidos invasores. Una unidad CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindrome Repeats) que se encuentra dentro del genoma de un organismo consiste en una matriz de secuencias repetidas interespaciadas por espaciadores únicos y está asociada con genes especiales que residen adyacentes a la matriz. Las secuencias espaciadoras son fragmentos de nucleótidos integrados a partir de un organismo invasor. El análisis genómico comparativo de secuencias CRISPR afirma una gran variación dentro de los sistemas CRISPR–CAS entre diferentes procariotas. Aquí, se dirige un análisis de las especies de arqueas completas para sus secuencias CRISPR junto con un estudio de caso. El análisis filogenético esbozado a partir de las secuencias CRISPR muestra una armonía a lo largo de las repeticiones directas de los organismos analizados sin rastro de similitud espacial. Además, se adquieren elementos CRISPR novedosos, además de los que anteriormente estaban presentes en la base de datos. Luego, los CRISPR se someten a alineación local mediante BLAST para garantizar que alguna de las secuencias muestre similitud con los genomas humanos y virales disponibles en NCBI.