Investigación inmunológica
Acceso abierto

abstracto

Evolución de un grupo de genes inmunitarios innatos (b-defensinas) a lo largo de las líneas ancestrales del pollo y el pinzón cebra

Roberto Ekblom

Antecedentes: las b-defensinas aviares (AvBD) representan un grupo de genes inmunitarios innatos con amplia actividad antimicrobiana. Dentro del genoma del pollo, el trabajo previo identificó 14 AvBD en un grupo en el cromosoma tres. El lanzamiento de un segundo genoma de ave, el pinzón cebra, nos permite estudiar la historia evolutiva comparativa de estos grupos de genes entre dos especies que compartieron un ancestro común hace unos 100 millones de años. Resultados: un análisis filogenético de los grupos de genes de b-defensina en el pollo y el pinzón cebra identificó varios casos de duplicación y pérdida de genes a lo largo de sus líneas ancestrales. En el genoma del pinzón cebra se identificó un grupo de 22 genes AvBD, todos ubicados dentro de 125 Kbp en el cromosoma tres. Se encontró que diez de los 22 genes estaban altamente conservados con genes ortólogos en el genoma del pollo. Los 12 genes restantes estaban todos ubicados dentro de un grupo de 58 Kbp y se sugiere que son el resultado de eventos recientes de duplicación de genes que ocurrieron después de la división galliformes-passeriformes (división G-P). Dentro del genoma del pollo, se descubrió que AvBD6 era una duplicación de AvBD7, mientras que el gen AvDB14 parece haberse perdido a lo largo de la línea ancestral del pinzón cebra. Los genes de b-defensina duplicados han tenido una acumulación significativamente mayor de sustituciones no sinónimas sobre sustituciones sinónimas en comparación con los genes que no han sufrido duplicación desde la división G-P. Los patrones de expresión de los genes de la b-defensina aviar parecen estar bien conservados entre el pollo y el pinzón cebra. Conclusión: Las comparaciones genómicas de los grupos de genes de b-defensinas del pollo y el pinzón cebra iluminan la historia evolutiva de este complejo de genes. A lo largo de sus líneas ancestrales, se han producido varios eventos de duplicación de genes en la línea de paseriformes después de la división de galliformes-passeriformes, lo que dio lugar a 12 genes nuevos en comparación con un solo evento de duplicación en la línea de galliformes. Después de los eventos de duplicación, los genes duplicados han estado sujetos a una presión de selección relajada en comparación con los genes no duplicados, lo que respalda los modelos de evolución por duplicación de genes.