Revista de Investigación y Desarrollo

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Acceso abierto

ISSN: 2311-3278

abstracto

Euro Biotechnology 2018: Single nucleotide polymorphisms and haplotype analyses in Tilapia fish inferred from mtDNA D-loop and Cyt-b regions- Ikpeme E V- Nigeria Federal University of Agriculture Abeokuta

Ikpeme E V

El pescado de tilapia es el pescado más cosechado y consumido después de la carpa a nivel mundial. Comercialmente, el pescado de tilapia se consume mucho con una cosecha mundial de aproximadamente 4.677.613 toneladas en 2013. Para enfatizar, China es el mayor productor mundial de tilapia con una producción de alrededor de 1.600.000 toneladas, mientras que en África; Egipto es el mayor productor de unos 800.000. Nigeria tiene una población estimada de más de 160 millones con una costa que mide aproximadamente 853 kilómetros. Esta vasta costa, según Osagie, se puede aprovechar para la cría de tilapia, que probablemente podría tener la capacidad de hacer una contribución significativa a la agricultura.

Según Oyakhilomen y Zibah, la brecha entre la oferta y la demanda de pescado es de aproximadamente 1,8 millones de toneladas. Esto se basó en el informe de que la demanda anual de pescado en Nigeria sería de aproximadamente 2,66 millones de toneladas. El pescado de tilapia ha recibido poca o ninguna atención de investigación comparativamente, a pesar de su importancia como rico en proteínas, potasio, fósforo, vitamina B12 y bajo contenido de grasa. El otro tema importante aterrador es la erosión genética en esta especie.de peces orquestados por la explotación indiscriminada y excesiva de la naturaleza por parte de los pescadores en un intento por cerrar la brecha entre la oferta y la demanda. La implicación, por lo tanto, es que si no se intensifican los esfuerzos, especialmente en la investigación orientada a domesticar, conservar e integrar el cultivo de tilapia en el programa agrícola en Nigeria, podría significar la ruina.

Sin embargo, la queja expresada tanto por los criadores como por los agricultores es el bajo crecimiento, que afecta la competencia en el mercado. Para mitigar esta deficiencia, se vuelve imperativo un análisis de diversidad sólido, que tendrá como objetivo la detección y selección de genotipos superiores de tilapia para la reproducción y la mejora. Indudablemente, las diferencias alélicas entre organismos de la misma especie se han convertido en una parte integral de los programadores agrícolas/mejoradores, cuyo objetivo es seleccionar reproductores e identificar especies amenazadas de extinción.para posibles medidas de conservación. Se han desarrollado y adoptado innumerables técnicas y métodos para el análisis genético, como la técnica basada en morfometría. Desafortunadamente, aunque simple y directo para la identificación y caracterización de poblaciones de peces, su confiabilidad se ha visto afectada por factores ambientales.

A pesar de la especificidad y el poder de resolución de otros marcadores moleculares como RAPD, SSR, ISSR, AFLP, se ha informado que los datos de secuencia de ADN son más informativos para explicar la relación genética entre especies de organismos. De los dos ADN genómicos principales, el nuclear y el mitocondrial, el ADN mitocondrial (mtDNA) se ha utilizado para estudiar estructuras de stock de invertebrados como peces, aves, reptiles y mamíferos. Habib et al. revisó que la variación del mtDNA se está adoptando como una herramienta confiable para determinar la diversidad genética dentro y entre las especies. La elección del ADNmt depende del hecho de que los vertebrados muestran más variaciones en el genoma mitocondrial que en el ADN nuclear debido a la rápida mutación .tasa y número de copias por celda, además de ser heredadas por vía materna.

Dos regiones a lo largo del mtDNA han atraído el interés de la investigación, especialmente en la construcción de relaciones filogenéticas entre especies. Estas son las regiones citocromo –b (cyt-b) y Dloop. La región Cyt-b del mtDNA se ha utilizado ampliamente en estudios de diversidad genética de muchas especies animales, principalmente peces. De manera similar, la región hipervariable/control (Dloop) del mtDNA flanqueada por los genes tRNApro y tRNAphe en el genoma mitocondrial se ha utilizado para caracterizar las especies de tilapia.

Según Chambers et al. El análisis filogenético se ha utilizado para rastrear el origen y la evolución de las especies, la predicción de las características fisiológicas, bioquímicas y estructurales de las secuencias. También se utiliza para evaluar la historia y las relaciones ancestrales. Hay varios puntos de referencia en el ADN que se pueden utilizar para la identificación y caracterización de especies de organismos, especialmente polimorfismos de nucleótido único (SNP). La investigación basada en SNP está orientada a estudiar las diferencias genéticas entre especiespara la predicción de fenotipos y filogenia. Dado que cuando los SNP ocurren dentro de un gen, crean diferentes variantes o alelos de ese gen y las secuencias tienden a transmitirse sin cambios a través de la generación; En este estudio actual, utilizando marcadores SNP en las regiones Dloop y cyt-b de mtDNA, se investigó la diversidad genética, los polimorfismos y el haplotipo en peces de tilapia muestreados de dos poblaciones en Nigeria.

MATERIALES Y MÉTODOS: Recolección de muestras, Extracción de ADN de tejido de pescado, Amplificación de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), Secuenciación del bucle D y Regiones de citocromo de ADNmt, Análisis estadísticos. Los resultados juntos revelaron una mayor diversidad de nucleótidos y haplotipos, más SNP detectados, selección positiva y haplotipos no compartidos en el bucle D del ADNmt en comparación con la región Cyt-b del ADNmt del pez tilapia, lo que da lugar a más polimorfismo. Por implicación, los peces tilapia dentro de estas poblaciones podrían emplearse en la cría selectiva y el mejoramiento genético, especialmente de la población sur-sur.

APROBACIÓN ÉTICA: La investigación se realizó sobre material biológico derivado de peces obtenidos de piscifactorías. Después de obtener el tejido para el análisis, la carne fue estándar para el consumo. Por lo tanto, nuestra investigación no requirió la aprobación del comité de Experimentación Animal.

Nota: Este trabajo se presentó parcialmente en el 21.er Congreso Europeo de Biotecnología los días 11 y 12 de octubre de 2018 en Moscú, Rusia.

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