Investigación inmunológica
Acceso abierto
ISSN: 1745-7580
ISSN: 1745-7580
Mohammed AA, Hashim O, Elrahman KAA, Hamdi A y Hassan MA
Antecedentes: Lyssavirus se considera un virus tropical, zoonótico y descuidado. Entre todas las especies de Lyssavirus que se sabe que existen en la actualidad, el virus Mokola es único y parece ser exclusivo de África. Este virus es responsable de una meningoencefalomielitis en mamíferos por lo tanto; La predicción in silico de epítopos de residuos proteicos apropiados es importante para producir una vacuna peptídica con un potente efecto inmunogénico y alérgico mínimo. El objetivo de este estudio fue diseñar una vacuna para el virus Mokola usando sus péptidos glicoproteicos como inmunógeno para estimular la respuesta inmune protectora.
Métodos y materiales: Se exploraron secuencias de glicoproteína G de Mokola del NCBI y luego se alinearon las secuencias para obtener regiones conservadas. Los epítopos nominados de la base de datos de epítopos inmunes se analizaron con diferentes herramientas de predicción para células B, células T MHC de clase II e I. Luego, las secuencias se alinearon con la ayuda de ClustalW implementado en el programa BioEdit.
Resultados y conclusiones: Para la prueba Bepipred de células B, el número total de epítopos conservados fue de 85. Para la predicción de accesibilidad de la superficie de Emini, 36 epítopos conservados superaban el umbral predeterminado de 1,0. En la antigenicidad de Kolaskar y Tongaonkar, 36 epítopos conservados dieron una puntuación por encima del umbral predeterminado de 1,045. Sin embargo, solo hay tres epítopos que pasan las tres pruebas (LYTIPEK, LAHQK, YPSVPS). La cepa de glicoproteína de referencia se analizó utilizando la herramienta de predicción de unión IEDB MHC-I para predecir el epítopo de células T. Se predijo que veinte péptidos conservados interactuarían con diferentes alelos de MHC-I. Para la predicción de la unión a MHC-II, se encontraron 47 epítopos conservados que interactúan con los alelos de MHC-II. Los péptidos GQILIPEMQ, FRRLSHFRK y FVGYVTTTF tenían la afinidad de unirse al mayor número de alelos MHC-II. La cobertura de la población mundial para los 3 péptidos más prometedores del MHC-I FVDLHMPDV, FVGYVTTTF y RLFDGTWVS fue del 67,42 %, mientras que la cobertura de la población mundial para los péptidos del MHC-II más prometedores fue del 99,77 %, para la unión a MHC-I y MHC-II, el péptido La cobertura de la población mundial de FVG TTTF fue del 99,31 %.