Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

In silico Mapeo de epítopos de glucosa-6-fosfato isomerasa: un autoantígeno de artritis reumatoide

Opuni KFM, Solomon S, Metzen F, Frommholz D, Koy C, Röwer C, Glocker MO, Illges H y Anderson PC

Los síntomas similares a los de la artritis reumatoide pueden iniciarse experimentalmente en ratones K/BxN ingenuos administrando simultáneamente los dos monoclonales anticuerpos 11H3 y 46H9. Ambos anticuerpos reconocen específicamente la glucosa-6-fosfato isomerasa (GPI), un autoantígeno conocido en pacientes con AR. Las secuencias de aminoácidos de las partes Fv de los anticuerpos se determinaron mediante la traducción de las respectivas secuencias de ADN del hibridoma y sirvieron para el modelado de la estructura tridimensional de las regiones del paratopo. El acoplamiento in silico de ambos modelos de estructura de anticuerpos Fv a las estructuras de rayos X del GPI murino homodimérico, así como al GPI humano homodimérico, predijo que el epítopo murino de los anticuerpos 11H3 comprendería secuencias de aminoácidos parciales QRVRSGDWKGYTGKS (aa134-148) y AAKDPSAVAK (aa232-241), generando un epítopo ensamblado (conformacional). El epítopo 11H3 en GPI humana abarca las secuencias de aminoácidos parciales correspondientes QRVRSGDWKGYTGKT (aa134-148) y AAKDPSAVAK (aa232-241). Se determinó que el epítopo del anticuerpo 46H9 constaba de la secuencia de aminoácidos de GPI murina parcial RKELQAAGKSPEDLEK (aa446-461) y la secuencia de aminoácidos de GPI humana RKELQAAGKSPEDLER (aa446-461), respectivamente, que se asemejan a epítopos consecutivos (lineales). Los epítopos predichos se verificaron mediante mapeo de epítopos espectrométricos de masas usando péptidos de epítopos sintéticos. El péptido QRVRSGDWKGYTGKS[GSMSGS] AAKDPSAAK incluía una pequeña secuencia espaciadora entre las secuencias del epítopo, imitando el epítopo ensamblado para el anticuerpo 11H3. El péptido RKELQAAGKSPEDLEK representaba el epítopo consecutivo del anticuerpo 46H9. Los epítopos de células B determinados de GPI y sus interacciones con los anticuerpos monoclonales proporcionan una comprensión estructural detallada de los mecanismos de aparición de la enfermedad inmunológica en un modelo de ratón con artritis reumatoide.