Revista de Ciencias Teóricas y Computacionales

Revista de Ciencias Teóricas y Computacionales
Acceso abierto

ISSN: 2376-130X

abstracto

El análisis in silico de los datos de las expresiones de la ERC en correlación con la diabetes mellitus revela un gen biomarcador

Mohd. Murshad Ahmed, Safia Tazyeen, Aftab Alam, Anam Farooqui, Shahnawaz Ali, Md. Zubbair Malik y Romana Ishrat

La enfermedad renal crónica (ERC) se está convirtiendo en un importante problema de salud pública en todo el mundo. La ansiedad actual de la enfermedad podría deberse al cambio de la patogenicidad subyacente. El objetivo de nuestro estudio fue proporcionar un análisis detallado de los datos de expresión génica de micromatrices de la ERC en correlación con la diabetes y la identificación de genes biomarcadores. Aquí, se utilizaron matrices de expresión de Affymetrix para identificar genes expresados diferencialmente en 22 y 69 muestras de CKD y diabetes, respectivamente. Además, describe algunas de las principales alteraciones biológicas observadas en el estado de CKD y describe procedimientos específicos para realizar una evaluación de calidad del chip Affymetrix Gene utilizando conjuntos de datos GEO (GSE70528, GSE11045) y también ilustra paquetes de control de calidad para resaltar la visualización para un análisis detallado. Identificamos 912 genes expresados diferencialmente en ERC y 629 en diabetes. A partir de una extensa comparación de la ERC con la diabetes, encontramos 80 genes comunes, de los cuales 29 se encontraron regulados hacia arriba y 51 hacia abajo. Además, en el análisis con NCG de estos 80 genes, se encontraron 10 genes comunes implicados en varios tipos de cáncer. Por lo tanto, los resultados enfatizan la importancia de estos 10 genes comunes expresados diferencialmente al considerarlos como biomarcadores para tres afecciones, diabetes, ERC y cáncer. Nuestros estudios han catalogado genes expresados diferencialmente que pueden desempeñar un papel importante en la patogenia de la ERC y podrían servir como biomarcadores.

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