Journal of Molecular Imaging & Dynamics
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abstracto

Efecto de los truncamientos del terminal C en la propensión a la agregación de la sinucleína Α: un estudio del potencial de la fuerza media

Airy Sanjeev y Venkata Satish Kumar Mattaparthi*

La α-sinucleína es una proteína intrínsecamente desordenada que tiene un papel destacado en la enfermedad de Parkinson (EP). Se ha informado que varias variantes familiares de a-sinucleína se asocian con la enfermedad de Parkinson hereditaria. Varios estudios han resaltado la presencia y asociación del extremo C de formas truncadas de a-sinucleína con α-sinucleína de tipo salvaje (WT α-sin) a un nivel mucho más alto en pacientes con enfermedades con cuerpos de Lewy y se ha encontrado que disminuyen la capacidad reductora. capacidades y potencialmente da como resultado la oxidación permanente de la a-sinucleína. Para comprender el impacto de los truncamientos C-terminales en la propensión a la agregación de WT α-syn, las interacciones intermoleculares entre ellos son fundamentales. Aquí demostramos las interacciones entre el WT α-syn y sus tres truncamientos C-terminales 95 (α-syn 95), 120 (α-syn 120) y 123 (α-syn 123), usando Simulaciones de Dinámica Molecular y Potencial de Media Estudio de fuerzas (PMF). Del estudio de PMF, observamos que el truncamiento C-terminal 120 (α-syn 120) se une fuertemente a WT a-syn que las otras formas truncadas de a-sinucleína. También notamos que el número de enlaces de hidrógeno es más grande, la puntuación de complementariedad de forma geométrica alta, el número mayor de residuos de interfaz y el área de interfaz para el heterodímero (WT α-syn-α-syn 120) que otros heterodímeros (WT α- syn - α-syn 95/123). Por lo tanto, podemos inferir que entre α-syn 95, α-syn 120 y α-syn 123, α-syn 120 muestran más asociación con WT α-syn. Esto se debe a que en α-syn 120, se han eliminado más aminoácidos en comparación con α-syn 123. Por el contrario, α-Syn 95 muestra menos interacción con WT α-syn debido a la ausencia de toda la región C-terminal. Nuestros hallazgos sugieren que cuanto mayor sea el truncamiento en la región Cterminal de la α-sinucleína, mayor será el efecto sobre su agregación.