Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto
ISSN: 0974-276X
ISSN: 0974-276X
Virupaksha A. Bastikar, Pramodkumar Gupta, Jaiprakash N. Sangshetti, Alpana V. Bastikar, Santosh S. Chhajed
La pandemia de coronavirus COVID 19 ha causado una amplia gama de daños en todo el mundo desde su inicio en diciembre de 2019 en Wuhan, China. Hasta la fecha no se ha identificado ningún fármaco prometedor para el tratamiento de la enfermedad. A la vista de esto, Los científicos han dilucidado las estructuras de rayos X de las proteínas en el virus SARS-CoV-2. Estos pueden actuar como probables dianas farmacológicas. para el diseño de medicamentos que es una necesidad urgente. Una de las principales proteínas del virus es su principal proteasa Mpro que se encarga de producir las poliproteínas del virus. En este estudio hemos utilizado la proteasa principal como objetivo para diseño y reutilización de fármacos para COVID-19. Se aplicaron dos enfoques para desarrollar un método rápido y eficaz tratamiento contra el virus. La reutilización de medicamentos a través del análisis de acoplamiento in-silico de los medicamentos existentes aprobados por la FDA fue un método y un cribado de alto rendimiento de moléculas de la base de datos ZINC frente a la proteasa principal fue el otra técnica aplicada. Se utilizaron dos protocolos de acoplamiento: un algoritmo de acoplamiento rápido para filtrar los aciertos o pistas moléculas seguidas de un procedimiento de acoplamiento de dinámica molecular basado en simulación para optimizar los aciertos obtenidos. Nosotros pudo observar una afinidad de unión basada en andamios definida contra la proteasa principal. Estos andamios eran de luteína, esteroides, morfina y quinolonas, CPT. La tiotepa se identificó como la molécula mejor acoplada con la unión más alta afinidad. Se identificaron moléculas únicas como luteína, betacaroteno, buprenorfina, etc., que se pueden utilizar como Medicamentos reutilizados contra el SARS-CoV-2. Además, estos andamios muestran farmacóforos únicos que se pueden utilizar para Diseñar posibles pistas novedosas contra el SARS-CoV-2 para tratamientos futuros.