Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Técnicas de procesamiento de señales digitales: cálculo de funcionalidades biológicas

Norbert Nwankwo y Huseyin Seker

Calcular las funcionalidades biológicas de las proteínas y presentarlas numéricamente es un enfoque que beneficiará el diseño de fármacos y vacunas. Por ejemplo, se sabe que la potencia de las vacunas se mide en términos de especificidad, que está determinada por el biorreconocimiento (afinidad) y la sensibilidad. Calcular el biorreconocimiento de péptidos empleados en el diseño de vacunas mediante procedimientos como las técnicas de Procesamiento Digital de Señales (DSP) en lugar de experimentaciones clínicas no solo da lugar a la manipulación de las secuencias de aminoácidos de los péptidos sino que también ayuda a determinar la grado de especificidad del anticuerpo generado, de ahí la potencia de la vacuna producida. Esto también brinda la oportunidad de optimizar los péptidos para las características biológicas deseadas. Además, comparar la potencia de los fármacos basados en péptidos a través del cálculo de sus funciones biológicas es un enfoque más rápido, más fácil y que ahorra recursos para las investigaciones farmacoterapéuticas. En este estudio, se explican y demuestran completamente dos técnicas de DSP. Son el modelo de reconocimiento resonante y el método de espectro informativo. Se emplean en el cálculo de algunas características fisiológicas de los péptidos plasmodiales (P18 y P32), que aún están en estudio para su posible uso como materiales para el diseño de vacunas contra la malaria. Además, los enfoques se utilizan para evaluar las actividades farmacológicas de dos inhibidores de Fusion (enfuvirtida y sifuvirtida). La enfuvirtida se usa actualmente para el tratamiento de la infección por el VIH/SIDA, mientras que la sifuvirtida todavía está en estudio. Nuestros resultados calculados demuestran una fuerte correlación con los hallazgos clínicos preliminares. También parecen sugerir que presentar las características biológicas en términos numéricos es un enfoque más fácil y más racional para diseñar medicamentos y vacunas, ya que ahorra recursos y tiempo a diferencia de los experimentos clínicos. Los métodos también parecen ayudar a simplificar la manipulación de los residuos de proteínas, que se emplean en el diseño y desarrollo de medicamentos y vacunas para obtener las máximas características biológicas.