Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Análisis proteómico diferencial de oligodendrogliomas y astrocitomas mediante la cuantificación iTRAQ

Shi-de Lin, Jing-zhe Li, Peng Wang, Yu-jie Zang y Ting-bao Zhao

Antecedentes: el astrocitoma y el oligodendroglioma son dos subtipos histológicos de tumores primarios del sistema nervioso central (SNC). Debido a la alta variabilidad citoarquitectónica y la falta de biomarcadores de diagnóstico precisos, distinguir clínicamente los astrocitomas y los oligodendrogliomas sigue siendo un desafío. Métodos: Los lisados de proteínas totales de muestras clínicas de astrocitoma y oligodendroglioma se analizaron mediante 2DLC/MS/MS y se cuantificaron mediante la cuantificación relativa y absoluta de etiquetas isobáricas (iTRAQ). Las proteínas expresadas diferencialmente se analizaron adicionalmente mediante el software Ingenuity Pathway Analysis (IPA). Por último, los posibles biomarcadores’ los niveles de expresión fueron validados por western blot. Resultados: Se identificaron un total de 1856 proteínas. Entre ellos, 83 proteínas aumentaron y 82 proteínas disminuyeron en muestras de astroglioma en comparación con oligodendroglioma. Nuestro estudio de bioinformática mostró que es más probable que este cambio en el perfil de proteínas en el astrocitoma tienda a mejorar la proliferación celular, la migración y la angiogénesis. Además, el análisis de la ruta mostró que el nivel de proteína de los componentes de la ruta de las GTPasas de la familia Rho era notablemente diferente entre el astrocitoma y el oligodendroglioma. Por último, dos miembros de la familia Rho de GTPasas, el homólogo de la proteína 42 de control de la división celular (CDC42) y la proteína transformadora RhoA (RHOA) se encontraron altamente expresados en astrocitoma y oligodendroglioma, respectivamente. Discusión: El análisis proteómico diferencial fue validado para distinguir entre astrocitomas y oligodendrogliomas. Dos miembros especialmente de la familia Rho de GTPasas, CDC42 y RHOA, serían indicadores potenciales para reflejar las características patológicas de estas dos enfermedades.