Transcriptómica: Acceso Abierto
Acceso abierto
ISSN: 2329-8936
ISSN: 2329-8936
Ashoktaru
La trucha de las nieves (Schizothorax richardsonii) es endémica de la región montañosa del Himalaya y prospera bien en un amplio régimen térmico (0-27 °C). La especie se puede utilizar como especie modelo para estudiar la respuesta al estrés abiótico y biótico de las especies de peces de agua fría. En el presente estudio, comparamos los transcriptomas hepáticos de Aeromonas hydrophilla desafiada (Ah+) y simulada (Ar-) S. richardsonii. La base de datos del transcriptoma para la especie se ha desarrollado con una cascada de genes expresados diferencialmente relacionados con el sistema inmunitario utilizando la secuenciación de ARN (extremo emparejado de 2 × 100 pb) realizada en la plataforma de secuenciación Illumina 2000. Entre los 50453 unigenes obtenidos del ensamblaje de novo, se anotaron 24464 unigenes, entre los cuales 82 unigenes se asociaron con genes de respuestas inmunitarias. Hubo 265 unigenes expresados diferencialmente (189 regulados al alza y 75 regulados a la baja) en Ah+ en comparación con el grupo Ah. La mayoría de los genes implicados en la regulación inmunitaria durante la patogenia bacteriana están relacionados con la región extracelular, la integridad de la membrana, la unión iónica, la transducción de señales, el procesamiento y la presentación de antígenos, el complejo proteico MHC de clase I, etc. En particular, 15 unigenes asociados con la respuesta inmunitaria y 9 unigenes Los términos relacionados con la ontología del gen de transducción de señales estaban significativamente desregulados en el grupo desafiado con bacterias. Cuatro genes inmunitarios Interleucina 1β1, prostaglandina-endoperóxido sintasa 2a & 2b, y se encontró que el dominio repetido de anquirina era muy activo contra A. hydrophilla. El presente estudio proporciona información preliminar sobre los posibles cambios a nivel molecular de este pez modelo potencial durante una infestación patógena.