Revista de Antivirales y Antirretrovirales
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abstracto

Detección de un nuevo coronavirus (SARS-CoV-2) mediante la reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa en tiempo real, China, 2020

Huahua Feng, Honglong Wu, Huagui Wang, Jianying Yuan, Lu Chen, Hui Jin, Lingling Yang, Jinyin Zhao*, Licheng Liu*, Weijun Chen*

Antecedentes: Durante el brote de neumonía inexplicable en la ciudad de Wuhan a fines de diciembre de 2019, se identificó un nuevo coronavirus llamado SARS-CoV-2 como la causa de este brote.

Métodos: Se estableció una reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real, que se dirige al gen orf1ab del genoma viral, para detectar e identificar el SARS-CoV-2. Utilizamos este ensayo para examinar 309 muestras de personas con sospecha de infección por SARS-CoV-2 en Wuhan. Luego se detectaron 6 coronavirus filogenéticos cercanos y 7 virus que podrían causar neumonía. Además, también se analizaron 57 muestras clínicas infectadas con otros virus y 77 muestras sanas.

Resultados: El límite de detección del ensayo fue de 6,25 copias por reacción en la detección de cRNA transcrito in vitro. Los resultados de la detección de frotis faríngeos y fecales de personas con sospecha de infección por SARS-CoV-2 mostraron que los frotis faríngeos eran más sensibles que los frotis fecales durante los primeros 15 días después del inicio de los síntomas (garganta: 56,80 %, fecal: 30,43 %), mientras que la situación se revirtió a los 15 días (garganta: 20,83%, fecal: 27,58%). Y las pruebas de pares emparejados sugirieron que las muestras de esputo tenían cargas de virus más altas que los hisopos de garganta en los pacientes (P<0.05). No hubo reacción cruzada cuando detectamos el cultivo inactivo de otros seis coronavirus (coronavirus humano 229E, NL63, OC43, HKU1, SARS-CoV, MERS-CoV) y otros siete virus (virus de la influenza A H1N1, virus de la influenza A H3N2, virus de influenza B, virus parainfluenza 1, 2 y 3, y virus respiratorio sincitial). Además, 27 muestras BALF de pacientes con neumonía infectados con coronavirus humano 229E, OC43, HKU1 o adenovirus humano 7, 30 frotis de garganta de pacientes infectados con H1N1 y 77 frotis de garganta de personas sanas dieron negativo en este ensayo.

Conclusión: Los resultados indicaron que el ensayo detectó de manera específica y sensible el SARS-CoV-2.