ISSN: 2471-9315
Fatah Tazerart, Jamal Saad, Muriel Militello, Sophie Alexandra Baron, Michel Drancourt*, Sylvain Godreuil*
Se recolectó una muestra de lavado broncoalveolar mediante broncoscopia de un paciente camboyano de 25 años con sospecha clínica de tuberculosis y se inoculó en Medio de Löwenstein-Jensen. Se investigaron las colonias de una bacteria Gram-positiva no cromógena y de rápido crecimiento. La microscopía electrónica de barrido mostró 1,2 ± 0,29 µm de largo y 0,58 ± Bacilos de 0,07 µm de tamaño que no pudieron identificarse mediante pruebas fenotípicas y espectrometría de masas de tiempo de vuelo de ionización por desorción láser asistida por matriz de rutina (API® ZYM, API®< /sup> Coryne and Biolog® Phenotype MicroArray tests). In vitro, el aislado fue sensible a isoniazida, amikacina y trimetoprim-sulfametoxazol. La secuenciación del genoma completo produjo un borrador de genoma de 5.703.981 pb que mostró un 69,3% del contenido de GC con 5.207 genes de proteínas codificantes y 56 genes de ARN predichos, incluidos 3 ARNr. La secuencia de rpoB mostró una similitud de secuencia del 93% con la de Mycobacterium parascrofulaceum en el complejo Mycobacterium simiae. La hibridación ADN-ADN derivada de la secuencia del genoma, OrthoANI y los análisis pangenómicos confirmaron que este aislado representaba una especie no descrita dentro del complejo M. simiae. Esta especie fue nombrada Mycobacterium cambodiensis por su fuente de aislamiento. El aislado fue depositado en la Collection de Souches de l’Unité des Rickettsies (CSUR) con el número CSURP9652.