Revista de Glicobiología
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abstracto

Estructura cristalina de la aglutinina del tubérculo Colocasia esculenta a 1,74 Å Resolución y sus interacciones cuaternarias

Rajagopal Chattopadhyaya, Himadri Biswas y Apurba Sarkar

Se han caracterizado y clonado muchos miembros de la familia de lectinas monocotiledóneas que se unen a la manosa, caracterizadas por su especificidad hacia la manosa. La mayoría de estas moléculas de lectinas contienen de 1 a 4 polipéptidos de aproximadamente 110 residuos cada uno. A partir de las estructuras cristalinas previamente resueltas de algunas de estas lectinas, en su mayoría de plantas no comestibles, se cree que estas lectinas poseen una estructura común de plegado β-prisma II. La principal proteína de almacenamiento del tubérculo de Colocasia esculenta es una lectina dietética ampliamente utilizada que se une a la manosa de las monocotiledóneas. Esta aglutinina de tubérculo contiene dos polipéptidos de 12,0 y 12,4 kDa por espectrometría de masas de tiempo de vuelo de ionización por desorción láser asistida por matriz. Por filtración en gel a pH 7,2, la lectina purificada tiene una forma α₂β₂ de masa molecular aparente de 48,2 kDa en solución pero a pH 3 , tiene el heterodimérico αβ forma. Los cristales de lectina se obtuvieron mediante el método de difusión de vapor de gota colgante a temperatura ambiente y los datos de difracción de rayos X de alta resolución se recopilaron utilizando una fuente de rayos X doméstica. Entre las estructuras cristalinas previamente resueltas de esta familia se encuentran las lectinas del ajo, la foca de Salomón, la campanilla blanca, el narciso y la campanilla española, pero se encontró que la secuencia de proteínas de la aglutinina del tubérculo Colocasia esculenta era la más cercana. a la de la lectina Remusatia vivipara que no tiene propiedad de unión a manosa simple. Usando el 2.4Å La estructura cristalina de la lectina Remusatia vivipara, la de Colocasia esculenta se ha resuelto mediante reemplazo molecular y posterior refinamiento cristalográfico y se tabulan y racionalizan las desviaciones cuadráticas medias entre varias lectinas. La unidad asimétrica en nuestra estructura cristalina de lectina contiene cuatro dominios β-prisma II o dos αβ heterodímeros, cada uno de los cuales forma un heterotetrámero α₂β₂ con una unidad relacionada con la simetría. La interfaz tetramérica obtenida de nuestra estructura cristalina se usa para explicar la conversión a dímeros en pH ácido. Se localizaron cinco iones de magnesio ordenados en la unidad asimétrica y se verificó la presencia de magnesio mediante espectroscopia de absorción atómica.