Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Crosslinkomics---Una nueva era de mapeo de interacciones proteína-proteína

Jie Luo y Jeff Ranish

Un objetivo principal de la proteómica es descubrir cómo las proteínas interactúan entre sí a través de redes y dentro de complejos. El desarrollo de entrecruzamiento químico integrado, espectrometría de masas y enfoques de computación (CXMS) han surgido recientemente como tecnologías poderosas para estudiar las interacciones de proteínas y tienen el potencial de avanzar significativamente en el campo del mapeo de interacciones de proteínas. Los péptidos entrecruzados identificados (dos péptidos unidos por entrecruzadores específicos) se pueden usar para inferir sitios de interacciones proteína-proteína y poner restricciones de distancia en los sitios de interacción en función de las propiedades de los entrecruzadores. Informes recientes sobre el mapeo de interacciones dentro de grandes ensamblajes como el complejo de 15 subunidades de ARN polimerasa II-TFIIF [EMBO J 29, 717-726], el ribosoma de 53 subunidades [JPR, 10(8):3604-3616] y un La preparación purificada de la ARN polimerasa II de 12 subunidades [MCP, mcp.M111.008318] sugiere que el campo de CXMS ha madurado hasta el punto en que su uso para mapear interacciones de proteínas en complejos grandes pronto se volverá más rutinario. CROSSLINKOMICS, que utiliza espectrometría de masas y enfoques computacionales para identificar péptidos entrecruzados químicamente de manera imparcial y de alto rendimiento, está emergiendo como un OMICS nuevo y prometedor que tiene el potencial de revolucionar el estudio de las interacciones proteína-proteína.