Investigación inmunológica
Acceso abierto

abstracto

Papel fundamental de la glicosilación en la determinación de la longitud y la estructura de los epítopos de las células T

Tam?s G Szab?, Robin Palotai, P?ter Antal, Itay Tokatly, L?szl? T?thfalusi, Ole Lund, Gy?rgy Nagy, Andr?s Falus y Edit I Buz

Antecedentes: mediante un enfoque combinado in silico, investigamos la glicosilación de los epítopos y los autoantígenos de las células T. El presente análisis de biología de sistemas fue posible gracias a las bases de datos actualmente disponibles (que representan proteomas completos, epítopos de células T humanas conocidas y autoantígenos), así como herramientas de predicción de glicosilación. Resultados: Analizamos la glicosilación probable de secuencias de epítopos de células T humanas extraídas de la base de datos ImmuneEpitope. Nuestro análisis sugiere que, en contraste con las entradas completas de SwissProt, solo una porción mínima de los epítopos de células T verificados experimentalmente está potencialmente N- u Oglicosilada (2,26 % y 1,22 %, respectivamente). El análisis bayesiano de las entradas extraídas de la base de datos de autoantígenos sugiere una correlación entre la N-glicosilación y la autoantigenidad. El análisis de secuencias generadas aleatoriamente muestra que la probabilidad de glicosilación también se ve afectada por la longitud del péptido. Nuestros datos sugieren que la falta de glicosilación de péptidos, una característica que probablemente favorece el reconocimiento efectivo por parte de las células T, podría haber resultado en una ventaja selectiva para que los péptidos cortos se conviertan en epítopos de células T. La longitud de los epítopos de células T está en la intersección de las curvas que determinan la especificidad y la probabilidad de glicosilación. Por lo tanto, el rango de longitud de los epítopos de células T de origen natural puede asegurar la máxima especificidad con la mínima probabilidad de glicosilación. Conclusión: los hallazgos de este enfoque bioinformático arrojan luz sobre los factores fundamentales que podrían haber dado forma a la inmunidad adaptativa durante la evolución. Nuestros datos sugieren que la hipo/no glicosilación basada en la secuencia de aminoácidos de ciertos segmentos de proteínas podría ser sustancial para determinar la inmunidad/autoinmunidad de las células T.