Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Correlación entre las subfamilias de proteínas de sacarosa sintasa, variaciones en la estructura y la expresión en conjuntos de datos de etiquetas de secuencias expresadas derivadas del estrés

Jayashree B, R. Pradeep, Anil Kumar y B. Gopal

La sacarosa sintasa es una proteína reguladora clave y un biomarcador potencial para la respuesta al estrés abiótico en plantas Estas enzimas metabólicas han sido ampliamente examinadas por sus variados roles funcionales. La regulación positiva de esta enzima glucolítica independiente de Pi y adenilato en diferentes contextos ambientales también se ha caracterizado ampliamente. Aquí presentamos un análisis de las características evolutivas de las sacarosa sintasas en un esfuerzo por correlacionar las variaciones en la secuencia con la estructura y función de esta proteína y su posible implicación en el mecanismo de respuesta al estrés en las plantas, como lo demuestran los estudios de distribución de transcripciones. Un análisis de las características evolutivas de esta enzima es útil dado el papel de esta proteína en la detección de azúcar, la importación de azúcar a los tejidos del receptor y el desarrollo de la planta. Con base en las características estructurales secundarias de las sacarosa sintasas y el mapeo de las variaciones de secuencia en el contexto del pliegue de estas proteínas, notamos aminoácidos conservados evolutivamente de posible importancia funcional. Además, también observamos la presencia de péptidos diana en algunas de estas proteínas, lo que sugiere una posible localización celular. Los resultados presentados en este manuscrito podrían ayudar a los estudios en curso sobre esta proteína como biomarcador potencial y gen candidato para el estrés ambiental.