Bioquímica y Farmacología: Acceso abierto
Acceso abierto

abstracto

Diseño computacional de inhibidores de péptidos cíclicos de la proteína antiapoptótica Calbindin-D28K

Benjamin G Bobay, Logan R Butler y John Cavanagh

Calbindin-D28K es una proteína sensora de calcio responsable de mantener la homeostasis del calcio celular y se sabe que tiene propiedades antiapoptóticas. Los objetivos de este estudio fueron proponer inhibidores peptídicos de calbindina-D28K basados en interacciones proteína:proteína conocidas, en particular la interacción de calbindina-D28K con caspasa-3. Un total de 160.000 posibles inhibidores de péptidos cíclicos se seleccionaron computacionalmente frente a calbindin-D28K. Se utilizaron varios mecanismos de puntuación para validar cada inhibidor peptídico cíclico: interacción calbindina-D28K. Se demostró que una secuencia de consenso general de los péptidos cíclicos contenía características electrostáticas positivas con al menos un aminoácido que contenía compuestos aromáticos. Posteriormente se muestra que la unión de uno de los péptidos cíclicos de mejor puntuación altera el sitio de unión de caspasa-3 en calbindina-D28K. En general, estos resultados sugieren que la calbindina-D28K es un objetivo farmacológico a través de los inhibidores de péptidos cíclicos que finalmente conducen a la reactivación de la caspasa-3 y la muerte celular natural.