Revista internacional de minería de datos biomédicos
Acceso abierto

abstracto

Comparación de secuencias de proteínas mediante el uso de vector de momento bajo representación binaria

Bikramjit amigo*

Este artículo elabora las secuencias de genomas completos y proteínas como señales reales y trata sus espectros en el dominio de la frecuencia mediante la aplicación de la transformación discreta de Fourier. Nuestro principal objetivo es agrupar la proteína secuencias considerando el tipo numérico de representación de las secuencias de proteínas, que es binaria; el la secuencia representada se toma como una señal real; DFT se aplica en cada secuencia binaria de cada nucleótido para obtener el espectro correspondiente. Luego se aplica la metodología Power Spectrum (PS) y se basa en los ‘vectores de momento’ Se obtiene la matriz de distancia para dibujar los árboles filogenéticos para la comparación de las secuencias de proteínas. Esta filogenética árbol se utiliza para representar la relación evolutiva entre organismos