Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Proteómica comparativa para el estudio de la distrofia muscular: intrínseca Cuestiones biológicas y analíticas asociadas con la utilización sistemática de muestras de tejido

Ashling Holanda y Kay Ohlendieck

Durante la última década, la proteómica basada en espectrometría de masas ha sido fundamental para el esclarecimiento detallado de los mecanismos bioquímicos implicados en las principales enfermedades neuromusculares. Aunque la identificación de proteínas derivadas de músculo en biofluidos es el foco principal de la investigación de biomarcadores de diagnóstico, el análisis proteómico a gran escala del tejido muscular patológico es de vital importancia para mejorar nuestra comprensión general de la desregulación que subyace en las enfermedades musculares complejas. Aquí, discutimos los problemas biológicos intrínsecos y las dificultades bioanalíticas que generalmente se asocian con la proteómica comparativa del tejido muscular. La utilización sistemática de mezclas celulares o muestras de tejidos completos como material de partida para el estudio de la patología neuromuscular se ve seriamente complicada por la heterogeneidad celular y la plasticidad fisiológica de los tejidos contráctiles. El análisis bioquímico integral del proteoma del músculo esquelético a menudo se ve obstaculizado por el amplio rango de expresión dinámica de las proteínas, las propiedades fisicoquímicas muy diferentes de las diferentes especies de proteínas musculares y la contaminación cruzada potencial de las muestras por proteínas muy abundantes. Por lo tanto, ni la metodología electroforética en gel ni la cromatografía líquida son capaces de separar apropiadamente todos los constituyentes del proteoma del músculo esquelético. Sin embargo, la aplicación de estrategias de extracción avanzadas, el uso de protocolos de fraccionamiento subcelular para reducir la complejidad de la muestra y la purificación por afinidad de distintas fracciones de proteínas antes del análisis espectrométrico de masas promete superar algunos de los problemas inherentes asociados con la proteómica del tejido muscular.