Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

La proteómica comparativa y el análisis de redes identifican PKC Epsilon Señalización subyacente de ácidos grasos de cadena larga

Tomo Yonezawa, Riho Kurata, Atsushi Tajima, Xiaofeng Cui, Hiroki Maruta, Hirofumi Nakaoka, Keiichi Nakajima y Hidetoshi Inoko

El ácido graso de cadena larga posee innumerables funciones en la función biológica de las células, no solo como sustrato energético sino también como sustrato para la síntesis de la membrana celular y como precursor de moléculas de señalización intracelular . Sin embargo, se sabe poco sobre las vías biológicas que son estimuladas por los ácidos grasos de cadena larga. Con el fin de identificar la ruta de los ácidos grasos de cadena larga, realizamos una electroforesis en gel bidimensional en las células tratadas con o sin oleato, y luego analizamos 648 puntos de proteína usando el software PDQuest y reducimos 22 puntos de cambio significativos por criterio estadístico. También intentamos determinar estos puntos mediante la consulta de la base de datos MALDI-QIT-TOF-MS y SWISSPROT. Identificamos 11 proteínas y predijimos la red biológica utilizando conjuntos de datos disponibles de la base de datos de interacción proteína-proteína. Esta predicción indicó que varias proteínas quinasas C (PKC) son la base de la señalización de ácidos grasos de cadena larga. De hecho, el oleato estimuló las vías de PKC predichas. En la matriz de expresión, el oleato aumentó significativamente solo la PKC épsilon, pero no otras PKC, en los niveles transcripcionales. En conjunto, nuestro análisis proteómico y de redes implica que la vía épsilon de la PKC desempeña un papel importante en la señalización de ácidos grasos de cadena larga.