Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Análisis comparativo de redes de interacciones proteína-proteína transductoras de señales de dos componentes en Enterococcus faecalis sp.

Ranjith N. Kumavath y Pratap D

Antecedentes: Interacciones proteína-proteína análisis de red de Enterococcus faecalis sp. en una comparativa
El enfoque ayuda a la disección de la función del gen, la posible transducción de señales y la virulencia  caminos Nuestra investigación arrojó luz sobre el análisis comparativo de redes de interacciones proteína-proteína que transducen señales de dos componentes en diez cepas diferentes de Enterococcus faecalis sobre la base del análisis de predicción de interacciones de proteínas y el análisis de interacciones huésped-patógeno utilizando las bases de datos STRING y HPIDB. Alrededor de 30-40 proteínas participan en el Sistema de Dos Componentes de Enterococcus faecalis.

Resultados: Se calcularon los parámetros de la red de interacciones proteína-proteína. El coeficiente topológico de casi todas las cepas de la red de Enterococcus faecalis siguió perfectamente una distribución de ley de potencia (correlación) 1.000; R-cuadrado) 1.000 y representó el mejor ajuste. Hemos descubierto una proteína (EF_3329) regulador de respuesta de unión al ADN, que no participa en toda la red de interacciones de proteínas, excepto las cepas X86 de Enterococcus faecalis. Hemos detectado una subred que no tiene ninguna interacción con la red principal excepto en Enterococcus faecalis D6.

Conclusiones: Este es un estudio comparativo novedoso sobre el sistema de dos componentes de Enterococcus faecalis que
proporciona un recurso útil para un análisis más detallado de las interacciones proteicas de las transducciones de señales de dos componentes en otros patógenos que amenazan la vida. El análisis adicional arroja luz sobre la detección de inhibidores de insilco que ayuda en el diseño de nuevos medicamentos.