Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Estudios comparativos y evolutivos de arilsulfatasa B de vertebrados, Genes y proteínas de arilsulfatasa I y arilsulfatasa J: evidencia de una Subfamilia similar a ARSB

roger s holmes

Se han informado múltiples genes de sulfatasa en el genoma humano, incluidos Arilsulfatasa B (ARSB), Arilsulfatasa I (ARSI) y Arilsulfatasa J (ARSJ). ARSB se localiza en los lisosomas y cataliza la hidrólisis de los grupos de condroitina y dermatán sulfato. Se llevaron a cabo análisis bioinformáticos de genomas de vertebrados utilizando secuencias de aminoácidos ARSB, ARSI y ARSJ humanas conocidas para estudiar la relación y la evolución de estos genes y proteínas. Se conservaron varias regiones de dominio y residuos clave, incluidos péptidos señal, residuos de sitios activos, secuencias de unión a metales (Ca2+) y sustratos, enlaces disulfuro y sitios de N-glicosilación. Los genes se expresaron ampliamente en tejidos humanos con niveles más altos en esófago (ARSB), pulmón (ARSI) y células de fibroblastos (ARSB). El ARSB humano era de mayor tamaño (> 200 kb) y contenía 8 exones codificantes, mientras que ARSI y ARSJ contenían solo 2 exones codificadores entre todos los genomas de vertebrados examinados. Las islas CpG estaban ubicadas dentro de los 5’ región de los genes humanos ARSB, ARSI y ARSJ. Además, se observaron seis y siete sitios de unión a miR dentro de la 3’-UTR de los genes ARSB y ARSJ humanos, respectivamente. Los análisis filogenéticos describen una propuesta para un gen SUL-3 de invertebrado primordial que actúa como un ancestro para eventos cruzados desiguales que generan estos tres genes en genomas de vertebrados.