Revista de Toxicología Clínica
Acceso abierto
ISSN: 2161-0495
ISSN: 2161-0495
Dharmendra Kumar Maurya
Objetivo: Hay varios contadores de colonias automáticos comerciales disponibles pero son relativamente caros y están asociados con varios problemas relacionados con la cuantificación. Algunos de los problemas clave en el conteo automatizado de colonias son la agrupación de colonias y los efectos de borde. Por lo tanto, el objetivo principal de este estudio es desarrollar un programa fácil de usar para determinar los parámetros de colonias del ensayo clonogénico.
Métodos: en el presente estudio, se empleó un algoritmo de cuenca hidrográfica junto con otras herramientas de ImageJ para desarrollar un programa adicional basado en ImageJ, es decir, ColonyCountJ, para calcular varios parámetros de colonias. Para probar este programa, hemos utilizado colonias obtenidas después de la exposición de células MCF-7 a diferentes dosis de radiación γ.
Resultados: los resultados obtenidos con este programa se compararon con el conteo manual y con el conteo automático proporcionado por el contador de colonias Oxford Optronix GelCount. Se encontró que nuestros resultados corroboraron bien tanto con el manual como con el programa comercial. En general, el rendimiento de ColonyCountJ con respecto al tiempo de procesamiento y la sensibilidad estuvo a la par con el contador de colonias comercial.
Conclusión: En conclusión, "ColonyCountJ" El programa adicional personalizado para ImageJ con parámetros optimizados es un método confiable para cuantificar las colonias obtenidas del ensayo clonogénico. Este programa será de gran utilidad para los investigadores que trabajan en el área de toxicología, radiobiología y biología del cáncer.