Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto
ISSN: 0974-276X
ISSN: 0974-276X
Jeffrey Cole, Patrick A Buszka, James A Mobley y Robert A Hataway
El veneno de araña es una rica mezcla multicomponente de polipéptidos neurotóxicos. Se ha categorizado el veneno de un pequeño porcentaje de las arañas actualmente clasificadas. Con el fin de determinar qué proteínas del veneno se expresan en nuestra especie, la araña errante Ctenus hibernalis, construimos un proteoma completo derivado de un extracto crudo de veneno utilizando un enfoque GeLC que requería una separación por electroforesis en gel desnaturalizado unidimensional combinada con la digestión enzimática de todo el corte de carril en muchas fracciones de peso molecular seguido de LC-ESI-MS2. De esta manera, identificamos 1182 proteínas con una confianza de >99 % que coincidían estrechamente con las secuencias derivadas de los genomas combinados tomados de varias especies similares de arañas. Nuestros resultados sugieren que las proteínas del veneno de C. hibernalis contienen varias proteínas con secuencias conservadas similares a otras especies. En el futuro, con la secuenciación de próxima generación (NSG), combinada con anotaciones extendidas, se utilizará para construir una base de datos genoproteómica más completa. Por lo tanto, se espera que con más estudios como este, habrá una comprensión continua y creciente de la composición genoproteómica del veneno para muchas especies derivadas de insectos, plantas y animales. Creemos que, en conjunto, estos enfoques conducirán a una comprensión mucho mejor de la biología detrás de los venenos de todos los tipos, así como a formas de tratar a los pacientes expuestos y, al mismo tiempo, ampliar y aprovechar los diversos aspectos positivos de las toxinas venenosas.