Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Caracterización y Dinámica Estructural de Expresado Diferencialmente Proteínas del Probiótico Eschericia coli Nissle 1917 en Respuesta a Cocos nucifera Sap

Chandrasekhar K, Sreedevi B, Sreevani S, Dileep A, Lebonah D, Seshapani P y Pramoda kumari J

El objetivo del presente estudio fue evaluar y analizar las estructuras proteicas expresadas en respuesta al probiótico E. coli Nissle 1917 tratado con savia de coco mediante MALDI-TOF-MS. Las manchas de proteínas expresadas se separaron mediante electroforesis en gel 2-D y las manchas se digirieron con la enzima tripsina para el análisis MALDI. En función de su relación masa-carga, las secuencias de proteínas expresadas se recopilaron a partir de los datos de búsqueda de Mascot. La secuencia se analiza mediante el software phyre-2 para el modelado de homología. Las estructuras predichas también fueron validadas por el software Rampage. De las proteínas expresadas, solo cinco proteínas mostraron una buena validación estructural en probióticos tratados con savia. Se concluyó que los perfiles de proteínas expresadas fueron analizados por 2D-PAGE y MALDI para comprender los mecanismos de estrés de la savia de cocoti en el probiótico E. coli Nissle 1917. El mecanismo de estrés induce muchas proteínas que están involucradas en el proceso metabólico, regulan la expresión génica, regulación SOS , actividad de transferasa, metabolismo de purinas y otras actividades relacionadas.