Genómica y biología fúngica
Acceso abierto
ISSN: 2165-8056
ISSN: 2165-8056
Lasse Bech, Peter Kamp Busk y Lene Lange
Trichoderma asperellum es un hongo filamentoso que puede producir y secretar una amplia gama de enzimas hidrolíticas extracelulares utilizadas para la degradación de la pared celular vegetal. El género Trichoderma ha atraído una atención considerable de la industria de la biorrefinería debido a la producción de enzimas que degradan la pared celular y la fuerte capacidad de secreción de este género. Aquí informamos un análisis extenso del transcriptoma de las enzimas que degradan la pared celular vegetal en T. asperellum. La producción de enzimas que degradan la pared celular por parte de T. asperellum se probó en una gama de materiales celulósicos en diversas condiciones. Cuando se cultivó T. asperellum en salvado de trigo, se detectó la mayor variedad de actividades enzimáticas y se identificaron en el transcriptoma un total de 175 glucósidos hidrolasas de 48 familias de glucósidos hidrolasas. Las glucósido hidrolasas se identificaron a nivel funcional utilizando la herramienta bioinformática Peptide Pattern Recognition, lo que permitió un descubrimiento eficiente de enzimas. Esto se usó además para volver a anotar las CAZimas presentes en cinco especies de Trichoderma disponibles públicamente, aclarando así las diferencias en las CAZimas a nivel funcional en contraposición al nivel de la familia de las glucósidos hidrolasas. Esta comparación respalda la teoría de que las glucósidos hidrolasas evolucionaron a partir de un ancestro común, seguido de una especialización en la que los hongos saprotróficos como T. reesei y T. longibrachiatum perdieron una cantidad significativa de genes, incluidas varias glucósidos hidrolasas.