Investigación inmunológica
Acceso abierto
ISSN: 1745-7580
ISSN: 1745-7580
Salvador Eugenio C. Caoili
La salud global debe abordar una carga de enfermedad en rápida evolución, de ahí la necesidad urgente de tecnologías genéricas versátiles ejemplificadas por vacunas basadas en péptidos. La predicción del epítopo de células B es crucial para diseñar tales vacunas; sin embargo, este enfoque hasta ahora ha sido en gran parte infructuoso, lo que provocó una mayor investigación sobre las razones subyacentes de su aparente insuficiencia. Dos obstáculos principales para el desarrollo de la predicción de epítopos de células B para el diseño de vacunas basadas en péptidos son (1) el paradigma de clasificación binaria prevaleciente, que exige la dicotomización problemática de las variables de resultado continuas, y (2) la falta de un modelo explícito de las consecuencias biológicas de la inmunización que son relevantes para las consideraciones prácticas de seguridad y eficacia. El primer obstáculo se elimina al redefinir la tarea predictiva como una estimación cuantitativa de los efectos biológicos empíricamente observables de la unión anticuerpo-antígeno, de modo que la predicción se compara utilizando medidas de correlación entre variables continuas en lugar de dicotómicas; pero este enfoque alternativo por sí solo no logra abordar el segundo obstáculo, incluso si los datos de referencia se seleccionan para reflejar exclusivamente la reactividad cruzada funcionalmente relevante de los anticuerpos antipéptido con antígenos proteicos (como lo demuestra la actividad biológica de la proteína modulada por anticuerpos), en particular cuando solo el anticuerpo-antígeno la unión en realidad se predice como un sustituto de sus efectos biológicos. Para superar el segundo obstáculo, el requisito previo es un esfuerzo deliberado para predecir, a priori, los resultados biológicos que tienen un significado práctico inmediato desde la perspectiva de la vacunación. Esto exige una visión de sistemas mucho más amplia y profunda de la inmunobiología que la que se ha invocado hasta ahora para la predicción de epítopos de células B. Tal punto de vista facilitaría la comprensión de muchos aspectos cruciales, aunque en gran parte ignorados, del problema del diseño de vacunas. De estos, la inmunodominancia entre los epítopos de células B es un tema unificador central que subsume los fenómenos inmunitarios de tolerancia, impronta y reenfoque; pero es significativo para el diseño de vacunas solo a la luz de la fisiopatología específica de la enfermedad, que para los procesos infecciosos se complica por la coevolución huésped-patógeno. Para respaldar mejor el diseño de vacunas basadas en péptidos, la predicción del epítopo de células B implicaría una estimación cuantitativa individualizada de los resultados biológicos relevantes para la seguridad y la eficacia. Los experimentos de inmunización pasiva podrían servir como un importante campo de pruebas inicial para la predicción de epítopos de células B en el camino hacia las aplicaciones de diseño de vacunas, al restringir la complejidad biológica para hacer que los problemas de predicción de epítopos sean más manejables computacionalmente.