Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Aplicación de herramientas informáticas para la identificación de miARN y sus SNP diana

George Priya Doss. C, Dike IP y Rao Sethumadhavan

MicroARN (miARN) son una clase de pequeños ARN no codificantes de proteínas que desempeñan funciones reguladoras importantes al dirigirse a la escisión o represión traslacional e implicados en diversas funciones biológicas. La acumulación de una gran cantidad de datos biológicos indica que los miARN pueden funcionar como supresores de tumores y oncogenes. La mutación, la expresión errónea y el procesamiento de miARN maduro alterado están implicados en la carcinogénesis y la progresión tumoral. Los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) comunes en los miARN pueden cambiar su propiedad al alterar la expresión y/o maduración de miARN y, por lo tanto, pueden tener un efecto en miles de ARNm objetivo, lo que resulta en diversas consecuencias funcionales. En este trabajo utilizamos herramientas computacionales para predecir el papel funcional de los mRNA dirigidos por miRNA en los genes del cáncer de colon. Hemos presentado un método que permite el uso de PupaSuite, UTRscan y miRBase como canalización para la predicción de miARN y su diana, y evaluado el papel funcional del ARNm en el cáncer de colon.