Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Una investigación del efecto de las mutaciones T15458C y T15663C en el gen CYB sobre la respiración a través de un método in silico

Mulyani R, Destiarani W, Rahmawati UM, Yusuf M, Subroto T, Iman P. Maksum*

La diabetes mellitus y las cataratas son enfermedades mitocondriales comunes en Indonesia y ocurren como resultado de la falta de ATP, que es producido en las mitocondrias a través de la fosforilación oxidativa (OXPHOS). La cadena OXPHOS está compuesta por cinco proteínas complejas codificadas por genes de ADN nuclear y ADN mitocondrial. Uno de esos genes es el gen CYB , con su locus en el ADN mitocondrial. El gen CYB codifica parte de la subunidad del complejo III, el citocromo b, un agente de transferencia de electrones. Se ha identificado una nueva mutación en T15458C en pacientes con diabetes mellitus tipo 2 y T15663C en pacientes con cataratas, ambos en el gen CYB, lo que lleva a alteraciones de los aminoácidos S238P e I306T. Este estudio investigó la relación entre las mutaciones T15458C y T15663C en el gen CYB del ADN mitocondrial con el proceso OXPHOS a través de un método in silico. El CYB de tipo salvaje y mutante se modelaron a través de modelos de homología usando Modeller 9.19 con una plantilla 5XTE, luego se evaluó usando el diagrama de Ramachandran, el puntaje de calidad del empaque y el perfil DOPE. Los resultados del análisis de la estructura del mutante S238P mostraron que la prolina actúa como un rompedor de hélices debido a la pérdida de un enlace de hidrógeno, mientras que I306T provoca una interacción hidrofóbica ya que el estabilizador de hélice se pierde en el mutante. Se supone que las mutaciones de fosforilación de la treonina también desestabilizan el complejo, como se demuestra por el ΔΔG < 0. En conclusión, las mutaciones S238P e I306T afectan la función del complejo III como agente de transferencia de electrones en el proceso respiratorio.