Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Un análisis evolutivo molecular in silico de especies seleccionadas de Phoma: un enfoque comparativo

Devanand M. Dangre, Dnyaneshwar P. Rathod, Aniket K. Gade y Mahendra K. Rai

El género Phoma, un patógeno común de las plantas, es taxonómicamente controvertido. Los sistemas convencionales de clasificación de Phoma son funcionales pero requieren una experiencia considerable para aplicarlos, lo que ha dado como resultado un género Phoma altamente polifilético. El advenimiento de las técnicas taxonómicas moleculares ofreció una solución para muchos problemas que estaban fuera del alcance de los enfoques taxonómicos clásicos. El método de construcción del árbol filogenético basado en datos moleculares es ampliamente utilizado para determinar relaciones evolutivas. En el presente estudio, hemos seleccionado 28S, 18S y 5.8S con secuencias de nucleótidos de la región ITS, secuencias de genes de actina y secuencias de genes de beta tubulina para el análisis in silico de la relación evolutiva. Los principales objetivos del estudio fueron evaluar las variaciones genéticas y la relación junto con la investigación, identificación, clasificación y relaciones evolutivas entre las once especies de Phoma seleccionadas. La confirmación de nuestros resultados se ha realizado mediante la aplicación de diversas pruebas estadísticas. Los resultados han revelado que las especies tienen varias unidades genéticas discretas y muy divergentes. Por el contrario, algunas especies tienen una gran similitud de secuencia e identidad entre sí, que se encuentran clásicamente como distintas. Nuestro análisis filogenético ha revelado que el primer evento de especiación es seguido rápidamente por un segundo evento de especiación en una de las dos poblaciones resultantes de especies de Phoma.