Revista de bioquímica y fisiología vegetal
Acceso abierto

abstracto

Un protocolo de rendimiento eficiente para la validación de patotipos mediante escisión de desajuste enzimático

Mohammed Jawhar, Bradley Till, Amer Albaterni, Alaa Skiheita, Mohammed Imad Eddin Arabi y Nizar MirAli

El diagnóstico temprano de patotipos fúngicos es uno de los aspectos más importantes para los fitomejoradores. Proporciona un medio rápido para seleccionar las líneas mutantes correctas para garantizar la durabilidad de la resistencia a enfermedades y también para las prácticas adecuadas de manejo de campo. Las herramientas de diagnóstico tradicionales para patógenos se han basado en cultivos específicos, enfoques basados en PCR y/o evaluación fenotípica de la respuesta a la enfermedad en genotipos de plantas específicos. Estos métodos detectan solo agentes patógenos conocidos, pueden introducir sesgos y pueden no reconocer nuevas variantes o razas debido a su limitado alcance. Si bien se ha descrito la escisión de desajuste enzimático para muchas especies de plantas y animales, también se necesita validar esa técnica para microorganismos haploides. En este trabajo se optimizó el método de bajo costo para patotipificar Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), el agente causal del marchitamiento por fusarium del banano (Musa spp.), se estableció usando nucleasa autoextraída y electroforesis en gel de agarosa. Se diseñaron cebadores específicos de genes a partir del genoma fúngico completo para su uso en la escisión de desajustes enzimáticos en representantes de Foc de las principales razas de los principales países productores de banano. Se usaron pares de cebadores específicos de genes para optimizar la división de desajustes enzimáticos y el descubrimiento de polimorfismos en dos genes SNF1 y FOW2. El protocolo es rápido, económico y puede distinguir patotipos en cepas Foc de forma sólida, sin una alta carga informática de secuenciación de ADN.