Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

âTodos y Ningunoâ Estrategia de Refinación; Pescando su proteína correcta de Proteomics Ocean

Sameh Magdeldin, Yutaka Yoshida, Ying Zhang, Bo Xu, Eishin Yaoita y Tadashi Yamamoto

Hemos desarrollado una metodología fácil de usar para refinar grandes conjuntos de datos proteómicos basados en lenguaje de marcado extensible (XML) con un enfoque muy estricto y simple utilizando un complemento codificado en VBA. Una metodología que denominamos (Todos y Ninguno). Las selecciones de candidatos objetivo diferencialmente significativos entre los grupos comparados se seleccionaron en función de su apariencia o ausencia, seguidas de una detección de péptidos con un enfoque novedoso y simple. Al probar la confiabilidad y la eficiencia de este método, se confirmó que All and None es un proceso aplicable para la detección inicial de biomarcadores biológicos en muestras complejas y extractos de tejido.