Técnicas Avanzadas en Biología y Medicina
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abstracto

Avances en la utilidad de micromatrices para la detección y el seguimiento de microbios transmitidos por los alimentos en la era genómica

Baoguang Li, Isha R Patel, Ben D Tall y Christopher A Elkins

Los brotes causados por microbios transmitidos por los alimentos plantean graves problemas de salud pública y seguridad alimentaria en todo el mundo. Existe una gran demanda de métodos rápidos, sensibles y de alto rendimiento para detectar y rastrear estos patógenos en alimentos, agua y otros entornos. Los avances recientes en la tecnología genómica del ADN han permitido análisis de cepas de alto rendimiento al capturar el contenido genómico total de las cepas y con filogenias comparativas concomitantes. Los microarreglos son particularmente aptos para destilar grandes cantidades de información de secuencias de ADN genómico, como los genes o rasgos genéticos de cientos de aislados transmitidos por alimentos en un solo experimento. Por lo tanto, durante las últimas dos décadas, la tecnología de micromatrices ha avanzado enormemente debido a la accesibilidad a miles de genomas microbianos completos y borradores y este progreso ha llevado al diseño y fabricación de micromatrices más nuevas que ahora pueden identificar variaciones de secuencias de genes hasta un solo polimorfismo de nucleótido. . La micromatriz de ADN sigue siendo una herramienta útil para el análisis genómico rápido y refinado de los microbios transmitidos por los alimentos. En esta revisión, centraremos principalmente nuestra discusión en la detección de patógenos, la identificación de serotipos y el seguimiento de la diversidad genética y la fuente de contaminación de las respectivas cepas transmitidas por los alimentos con nuestra experiencia de primera mano en el uso de esta tecnología.