Revista de Antivirales y Antirretrovirales
Acceso abierto
ISSN: 1948-5964
ISSN: 1948-5964
Asit K. Chakraborty
Anteriormente predijimos la proteína del virus Corona Nsp2 como topoisomerasa de ARN a través de la homología de aminoácidos entre la topoisomerasa de ADN de Vibrio haemolytica IA/IV, así como ADN primasa, ADN girasa y bi-subunidad Trypanosoma brucei ADN topoisomerasa IB. Muchas topoisomerasas de ADN I/III tienen actividad de topoisomerasas de ARN y estas enzimas ubicuas se conservan y participan en la regulación de la replicación y la transcripción. Hemos comprobado aquí el perfil mutacional de la topoisomerasa de ARN Nsp2 analizando > 10000 orf 1a 4405 aminoácidos de longitud de la poliproteína del virus Corona. Las proteínas mutantes se seleccionaron mediante búsqueda BLAST que tenían una similitud de secuencia del 99,84 % y se analizaron 181-818 aa de proteína NsP2 (identificación de proteína QIU82057) utilizando el software CLUSTAL Omega. Encontramos 26 mutaciones diferentes en las que la mayoría de los cambios se seleccionaron en isoleucina y alanina en valina o leucina en fenilanalina, lo que señala la naturaleza conservada de la topoisomerasa de ARN del virus Corona. Se encontraron mutaciones importantes sin sentido muy abundantes en I120F (isoleucina a fenilalanina). Otras mutaciones importantes fueron R27C, I198V, T85I, L410F, I559V y P583S. La mutación I120F fue abundante en aislamientos australianos y su propagación se observó en Bangladesh y otros países como EE. UU. Sugerimos que la abundante mutación I120F de la topoisomerasa Nsp2 puede aumentar la transmisión del virus Corona al estabilizar la estructura del ARN para un empaquetamiento eficiente del virus. Curiosamente, tales mutaciones se encontraron en asociación con la mutación D614G de la proteína Spike, conocida por aumentar la infectividad en >70%. Por el contrario, todos los mutantes P583S Nsp2 analizados no tenían mutación de la proteína de punta D614G concurrente. Se detectaron muchas mutaciones silenciosas (5-7) mediante análisis de todo el genoma, pero ninguna mutación de la proteína N501Y Spike. Este es el primer informe que predice un vínculo de mayor transmisión del virus Corona con la mutación I120F de la proteína Nsp2 y puede ser importante para descubrir nuevos medicamentos antivirales.