Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Detección de islas CpG metiladas aberrantemente en el cáncer de colon

Qianwen Zhang, Hongwei Wu y Hao Zheng

La metilación del ADN es un tipo de modificación epigenética que implica la adición de un grupo metilo al ADN a través de la ADN metiltransferasa (DNMT). En las células eucariotas, la metilación del ADN se produce en el 5’ posición de carbono del residuo de citosina en el contexto del dinucleótido de citosina guanina (CpG). La metilación del ADN es crucial para el desarrollo normal del organismo, que incluye la diferenciación celular, la impresión genómica, la inactivación del cromosoma X, la supresión de la transcripción de retrovirus, etc. y la progresión de los cánceres. En este artículo, construimos un modelo computacional para identificar aquellas islas CpG que están metiladas en el cáncer de colon pero no metiladas en las células normales. Desarrollamos un modelo de predicción de alta precisión para aquellas islas CpG cuya diferenciación de metilación está relacionada con el cáncer de colon y evaluamos estos modelos a través de extensos experimentos de prueba de generalización y validación cruzada.