Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Una herramienta para mapear y mostrar relaciones y patrones espaciales entre modificaciones postraduccionales en dos y tres dimensiones

Alistair VG Edwards, Gregory J Edwards y Martin R Larsen

Antecedentes: Anteriormente publicamos una herramienta de software para el análisis de los entornos alrededor de la modificación postraduccional de proteínas basada en secuencias. Este artículo describe los avances de esta herramienta, centrados principalmente en los métodos para describir las relaciones espaciales entre las modificaciones postraduccionales en 2D y 3D.

Resultados: demostramos que podemos extraer información significativa sobre las distribuciones de modificación de proteínas y las interrelaciones utilizando este software. Mostramos ejemplos de relaciones de agrupamiento de modificación basadas en nuestros propios datos y discutimos el uso potencial de esta y otras herramientas similares en el futuro.

Conclusiones: Anticipamos que esta herramienta será útil para describir cómo y cuándo las células implementan las modificaciones postraduccionales, revelando así aspectos novedosos de la regulación celular.