Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Un descubrimiento basado en el genoma del secretoma de S. mansoni para identificar objetivos terapéuticos

Mandage RH, Jadhavrao PK, Wadnerkar AS, Varsale AR y Kurwade KK

La motivación detrás del análisis del genoma a gran escala de S. mansoni fue explorar la posibilidad de descubrir el secretoma que se secreta con frecuencia en la interfaz del parásito y Se supone que el huésped juega un papel crucial en el parasitismo al suprimir la respuesta inmune, para ayudar a la proliferación de la infectividad. Aquí, presentamos una tubería eficiente de metodología bioinformática para identificar proteínas de parasitismo candidatas dentro del secretoma de S. mansoni de respuestas inmunes en el huésped infectado. Las 3700 proteínas deducidas del genoma de S. mansoni se analizaron para determinar la presencia o ausencia de péptidos señal secretores. Identificamos 32 proteínas que llevan un péptido señal secretado N-terminal pero deficientes en restos de anclaje de membrana adicionales. En particular, identificamos proteínas involucradas en la síntesis de ATP, el equilibrio redox, el plegamiento de proteínas, la gluconeogénesis, el desarrollo y la señalización, las vías metabólicas de nucleótidos y de barrido, la modulación de la respuesta inmune. La mayoría de estas proteínas definen su potencial para el diagnóstico inmunológico y el diseño de vacunas. Aquí se ha realizado un intento sistemático para desarrollar un método general para predecir las proteínas secretoras de un parásito con alta eficiencia y precisión.