La bioquímica de plaguicidas se ocupa del modo de acción de los agentes fitosanitarios, como insecticidas, fungicidas, herbicidas y compuestos similares, incluidos los agentes de control de plagas no letales, la biosíntesis de feromonas, hormonas y agentes de resistencia vegetal. Se enfatiza principalmente en Bioquímica y Fisiología de la toxicidad comparativa, Modo de acción, Fisiopatología, Reguladores del crecimiento vegetal, Resistencia, Otros efectos de los plaguicidas tanto en parásitos como en huéspedes.