Transcriptómica: Acceso Abierto
Acceso abierto
ISSN: 2329-8936
ISSN: 2329-8936
Artur Teixeira de Araujo Junior, Daniel da Rosa Farias, Railson Schreinert dos Santos, Marcelo Nogueira do Amaral, Luis Willian Pacheco Arge, Danyela de Cássia Oliveira, Solange Ferreira da Silveira Silveira, Rogério Oliveira de Sousa, Eugenia Jacira Bolacel Braga, Luciano Carlos da Maia y Antonio Costa de Oliveira
El arroz (Oryza sativa L.) es un cultivo alimentario básico mundial y un organismo modelo importante para los estudios de plantas. Informes recientes han demostrado que el empalme alternativo se ve afectado por muchas condiciones estresantes, lo que sugiere su importancia para la adaptación a entornos adversos. Debido a la poca información sobre este tema, este estudio tuvo como objetivo explorar los cambios en los patrones de empalme que ocurren en respuesta a la alta concentración de hierro en las soluciones nutritivas. Aquí cuantificamos diferentes tipos de uniones y empalmes en el transcriptoma de un cultivar de arroz relativamente tolerante BRS Querencia, bajo exceso de hierro con una concentración de 300 mg L-1 Fe+2. Las plantas mantenidas en condiciones estándar (control) presentaron 127.781 uniones de empalme diferentes, mientras que las plantas estresadas presentaron 123.682 uniones diferentes. Se encontraron uniones canónicas (98,85 % y 98,91 %), semicanónicas (0,73 % y 0,70 %) y no canónicas (0,42 % y 0,40 %) en las plantas control y estresadas, respectivamente. La retención de intrones fue el evento más frecuente (44,1% y 47,4%), seguido de 3’ sitio de empalme (22,6 % y 21,9 %), omisión de exón (18,9 % y 17,3 %) y alternativa 5’ sitio de empalme (14,4% y 13,4%) en plantas control y estresadas, respectivamente. También encontramos 25 genes expresados diferencialmente (cinco regulados hacia arriba y 20 hacia abajo) que están relacionados con modificaciones postraduccionales. Estos resultados representan un paso importante en la comprensión de cómo se producen las respuestas al estrés de las plantas en un genotipo tolerante al hierro, al descubrir nuevos genes implicados en la respuesta al estrés por hierro.