Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Análisis de proteómica de escopeta de proteínas urinarias expresadas diferencialmente Involucrado en el carcinoma hepatocelular

Chao-Jen Kuo, Shen-Nien Wang, Shih-Shin Liang, Shu-Wen Chi, Zong Jing Yu, Edward Hsi, King-Teh Lee y Shyh-Horng Chiou

Numerosas investigaciones que subyacen al diagnóstico del carcinoma hepatocelular (CHC), así como la detección en una etapa temprana basada en la concentración del antígeno de superficie del virus de la hepatitis B (HbsAg) en el suero y los metabolitos de aflatoxina en la orina, se han realizado comúnmente. reportado en la literatura. Hasta la fecha, estos biomarcadores, aunque específicos y precisos, no son universales para la detección de CHC provocado por todos los factores causales. Además, los biomarcadores potenciales pueden estar presentes en bajas concentraciones en contraste con la presencia de abundantes proteínas de interferencia con un amplio rango dinámico. El objetivo de este estudio es establecer una plataforma de análisis operativo de una herramienta de diagnóstico eficaz y no invasiva con una alta sensibilidad para explorar los perfiles de expresión de proteínas mediante proteómica de escopeta utilizando espectrometría de masas en tándem acoplada con nanocromatografía líquida (nanoLC-MS/MS) e isótopo estable dimetilo. etiquetado Las proteínas urinarias expresadas diferencialmente se identificaron y compararon mediante los patrones espectrales de masas de sus fragmentos peptídicos generados a partir de la digestión con proteasas. En nuestros resultados, el análisis proteómico cuantitativo de las proteínas expresadas diferencialmente en la orina identificó al menos 21 candidatos a biomarcadores de proteínas con altos niveles de confianza. Además, hemos identificado 14 proteínas con regulación positiva (relación D/H de isótopos estables ≥ 1,5) y 7 con regulación negativa (relación D/H ≤ 0,6). La disminución o el aumento sistemáticos de estas proteínas marcadoras identificadas pueden reflejar potencialmente las aberraciones morfológicas y las etapas enfermas del hígado a lo largo de la evolución progresiva del CHC. Los resultados sentarían una base sólida para el trabajo futuro con respecto a la validación y la traducción clínica de algunos biomarcadores identificados en diagnósticos y terapias específicas para varias clases de CHC.