anurag anand
Los estudios de secuenciación de alto rendimiento y las nuevas herramientas de software están revolucionando los análisis de la comunidad microbiana, pero la variedad de métodos experimentales y computacionales puede resultar abrumadora. En esta revisión, discutimos algunos de los diferentes enfoques para la creación de perfiles comunitarios, destacando las fortalezas y debilidades de varios enfoques experimentales, metodologías de secuenciación y métodos analíticos. También abordamos una pregunta clave que surge de varios Proyectos de Microbioma Humano: ¿Existe un núcleo sustancial de organismos o linajes abundantes que todos compartimos? Parece que en algunos hábitats del cuerpo humano, como la mano y el intestino, la diversidad entre los individuos es tan grande que podemos descartar la posibilidad de que alguna especie se encuentre en gran abundancia en todos los individuos: es posible que, en cambio, el enfoque deba ser estar en taxones de nivel superior o en genes funcionales.