Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Sondeo de proteínas fitofúngicas para la actividad fungicida mediante acoplamiento molecular

Pooja Mishra, Mu ru gesh Eswaran, Nitya Meenakshi Raman y Tanushri Kaul

Antecedentes: Las enfermedades fúngicas de las plantas son las causas principales de la pérdida de follaje y cosechas que eventualmente afectan el resultado económico general y la calidad del rendimiento. Por lo tanto, se emplean varios compuestos químicos para erradicar los hongos en la agricultura.

Métodos: Las estrategias de detección virtual y acoplamiento molecular se presentan como excelentes alternativas para encontrar compuestos de plomo. Los compuestos principales para cada infección fúngica se acoplaron a la secuencia de la proteína objetivo y se evaluó la interacción más fuerte.

Hallazgos: Varias moléculas fueron tomadas bajo estudio, por ser los ligandos diana para provocar una reacción fungicida en el sistema patógeno de la planta. La selección de moléculas se realizó minuciosamente para producir los resultados. Los ligandos identificados a través de este estudio nos permiten hacer que la planta huésped luche contra el patógeno fúngico y prevenga la aparición de la enfermedad. Las interacciones se han estudiado a fondo con varios softwares como SPDBV y PyMol y a través de varias bases de datos en línea como STRING, GenePept, PDB, UniProt, PatchDock, Protein Structure Prediction Server -2 y otros para la evaluación general de la molécula de fármaco diseñada y para estudiar su efectos generales para una mayor eficacia general y para prevenir la aparición de la enfermedad fúngica y el manejo de los patógenos fúngicos en la agricultura contra varias plantas económicamente valiosas. Los compuestos principales revelaron varios contactos hidrofóbicos y polares que se demostraron mediante la comparación de interacciones.

Aplicaciones: La afinidad molecular del compuesto fungicida se ha probado contra el patógeno objetivo y los componentes del sistema huésped para comprender la interacción y extraer el funcionamiento y el análisis. Se ha estudiado la compatibilidad entre la molécula y la proteína para descifrar la eficacia de la molécula y sus efectos en el sistema. Los presentes resultados nos permiten establecer compuestos líderes que pueden usarse para el desarrollo de fármacos antifúngicos, aunque se deben realizar estudios de relación de actividad estructural.