Diseño de fármacos: acceso abierto

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Acceso abierto

ISSN: 2169-0138

abstracto

Análisis de interacción, dinámica y estabilidad de algunos aglutinantes del surco menor con B-DNA Dodecamer 5' (CGCAAATTTGCG)-3'

Anwesh Pandey, Anurag Upadhyaya, Suresh Kumar, Anil Kumar Yadav

El ácido desoxirribonucleico (DNA) ha sido un objetivo celular conocido para muchos agentes antibacterianos y anticancerígenos debido a a sus tendencias de expresión génica. La interacción de las drogas con el ácido nucleico es una de las características importantes en farmacología y juega un papel importante en la comprensión del mecanismo de acción de los fármacos y en el diseño de Medicamentos más eficientes con efectos secundarios mínimos. Los furanos se conocen desde hace mucho tiempo y a menudo se afirma que tienen Poseía diversas tendencias medicinales y terapéuticas. En el trabajo de investigación actual, dos clases de moléculas a saber, 2,4-bis(4-amidinofenil)furanos y diamidino 2,5-diarilfuranos invertidos, fueron estudiados computacionalmente por su fuerzas de unión relativas y tendencias estables de formación de complejos con ADN (PDB Id: 4AH0). acoplamiento molecular se realizó para predecir el bolsillo de unión del fármaco en la vecindad del ADN y se realizó la dinámica molecular para estudiar la dinámica de interacción en apoyo del modo de unión predicho. El acoplamiento reveló que el sitio de unión era una región rica en AT, como la preferida por los ligantes del surco menor. Los análisis RMSD y RMSF se realizaron a partir de los datos obtenidos. de estudios de MD; el estudio anterior reveló que los ligandos permanecen unidos a las posiciones de unión preferidas del ADN sin desviaciones considerables en su surco menor; sin embargo, el último reveló la estructura topológica de ADN que permanece intacto durante todo el curso de la simulación, lo que infiere la estabilidad de los complejos fármaco-ADN. Este estudio describe las propiedades y dinámicas del ADN en la interacción con derivados furánicos, tomando la cuenta de la deformación sobre la unión que puede desempeñar un papel importante en el descubrimiento de un nuevo aglutinante de surco menor como regulador de la expresión génica. En este estudio, también realizamos el Análisis Orbital de Enlace Natural (NBO) utilizando Paquete de programa Gaussian 09 para el cálculo de enlaces e interacciones orbitales intra e intermoleculares en el Estructura química electrónica optimizada, particularmente transferencia de carga y energía de ganancia de estabilización.
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