Revista internacional de minería de datos biomédicos
Acceso abierto

abstracto

Estudios de Insilco sobre cultivares del genoma del mango y desarrollo de una herramienta de análisis

Rabia Faizán

           Resumen

El mango es uno de los aclamados y quinto subtropical/ cultivos de productos orgánicos tropicales en todo el mundo con la creación enfocada en India y el sudeste asiático. Últimamente, ha habido un interés general en la genómica del mango para ofrecer dispositivos para la selección asistida por marcadores y la afiliación de atributos. No hay activos genómicos investigados electrónicamente disponibles para el mango especialmente. Posteriormente, se necesitó un activo genómico total de mango para el desarrollo en el examen y los ejecutivos de germoplasma de mango. En esta empresa, hemos realizado una investigación casi transcriptómica de cuatro cultivares de mango, por ejemplo, cv. Langra, cv. Zill, cv. Shelly y cv. Kent de Pakistán, China, Israel y México individualmente.

La información cruda se adquiere a través de un conjunto de arreglos De-novo que produjo 30,953-85,036 unigenes a partir de conjuntos de datos de RNA-Seq de cultivares de mango. El compromiso está destinado a brindar a los principales investigadores y a la población en general un activo genómico del mango y permitir que el cliente compare su información con nuestros conjuntos de datos del genoma del mango examinados de cuatro cultivares (cv. Langra, cv. Zill, cv.Shelly y cv.Kent). Un activo genómico web de mango MGdb, depende de la ingeniería de 3 niveles, creado utilizando Python, base de datos de registro de nivel y JavaScript. Contiene los datos de cualidades anticipadas de todo el genoma, los unigenes explicados por cualidades homólogas en diferentes especies y términos GO (Gene Ontology) que dan una breve mirada a las características en las que se incluyen. Este activo genómico web puede ser de gran utilidad en la evaluación de la exploración, la mejora de las prescripciones, la obtención de cualidades hereditarias y proporciona una valiosa respuesta bioinformática para el examen de la información de sucesión de nucleótidos. Presentamos aquí el primer recurso genómico basado en la web del mundo, especialmente de mango para la mejora hereditaria, y la junta de mangogenome.