Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Descubrimiento in silico de nuevos dominios proteicos en Streptococcus mutans

Anand Ramesh Varsale, Amol Shriram Wadnerkar, Rajendra Haribhau Mandage y Priyanka Khasherao Jadhavrao

Streptococcus mutans es el principal agente etiológico de la caries dental en todo el mundo y se considera el más cariogénico de todos los estreptococos orales. Buscamos expandir nuestra comprensión de este organismo a nivel molecular a través de la identificación y la predicción de la función de nuevos dominios de proteínas mediante dos enfoques automatizados que utilizan HMM y BLAST para desarrollar un conjunto completo de dominios, que luego se analizaron manualmente. Se identificó un conjunto final de 19 nuevos dominios y familias. Esto mejora nuestra comprensión tanto de S mutans como de los mecanismos moleculares bacterianos generales, desde la síntesis de proteínas hasta la acción catalítica. Además, demostramos que con este tipo de método in silico es posible generar con bastante rapidez nueva información biológica a partir de datos previamente no correlacionados para aumentar la tasa de descubrimientos en el laboratorio.