Inmunoterapia: Acceso Abierto
Acceso abierto

abstracto

Transcripciones inmunes de la ostra del Pacífico: larvas de Crassostrea gigas que cambian de expresión como resultado del desafío de las bacterias

Jing Fang, Xiaohui Cai, Fengyi Mao, Hongyu Li, Honglin Chen, Minhua Qian, Jacob R. Hambrook, Patrick C. Hanington, Xinzhong Wu

Antecedentes: Los moluscos marinos que viven en áreas intermareales y estuarinas, como las ostras, enfrentan desafíos de patógenos durante su desarrollo. La infección por bacterias como Vibrio alginolyticus representa un factor importante que afecta el desarrollo de las larvas y con frecuencia conduce a una alta mortalidad de la ostra del Pacífico, Crassostrea gigas. Se sabe que la respuesta inmune de la ostra juega un papel importante en la protección del animal durante el desarrollo al mitigar las consecuencias de la infección.

Resultados: En este estudio, llevamos a cabo un análisis exhaustivo de la respuesta inmunitaria de C. gigas larvas a V. alginolyticus desafío. Secuenciamos el transcriptoma de la larva C. gigas a las 0 horas lo que significa la larva de ostra sin ningún tratamiento como control ya las 6, 12, 24, 48 y 72 horas post-infección. Después de RNA-seq, las lecturas sin procesar están disponibles a través del archivo de lectura de secuencias NCBI con el número de acceso PRJNA623063. Después del filtrado, se produjeron y ensamblaron un total de 58,24 Gb de lecturas limpias utilizando el genoma de referencia de C. gigas. La distribución de la calidad Q30 fue superior al 90,88 % para cada muestra y el contenido de GC osciló entre el 41,27 % y el 42,91 %. En comparación con las secuencias en las bases de datos COG, GO, KEGG, Swiss-Prot y NR, hubo 1267, 1112, 2187, 682, 1133 genes expresados diferencialmente anotados a las 6, 12, 24, 48 y 72 horas después de la infección, respectivamente. . Numerosos genes relacionados con el sistema inmunitario mostraron una expresión diferencial que varió con el tiempo: receptores tipo toll, proteínas con motivo tripartito, factores similares a lectina, receptores depuradores, componentes de vías de señalización como el factor de diferenciación mieloide 88 y proteínas de estrés como la proteína de choque térmico de 70 kDa se encontró que todos eran más abundantes después de V. alginolyticus desafío en comparación con el control. Para el análisis, estos genes se dividieron en varias categorías, como receptores de reconocimiento de patrones, proteínas similares al fibrinógeno, patrones moleculares asociados a daños, factores del complemento, etc. . gigas durante las primeras 72 horas de infección, como TRIM2, TRIM45, TRIM56, TRIM71, receptor de manosa de macrófagos 1, apolipoproteína D, citocromo P450, proteína relacionada con Rho, proteína 1 inducida por estrés, HSP68 , HSP75, HSP70 B2, proteína de unión a hemo 1, proteína de unión a hemo 2, proteína de unión a metales pesados HIP, hemicentina-1, etc. Estos Las categorías generales nos permitieron generar un perfil de respuesta inmune para C. gigas durante las primeras 72 horas de la infección. Estos resultados indican que la infección bacteriana induce un patrón complejo de expresión génica inmunitaria en C. gigas larvas.

Conclusión: Nuestro estudio facilitará la investigación específica de la función de factores inmunitarios específicos que pueden explicar la diversidad y evolución de las moléculas inmunitarias de los invertebrados y conducir al desarrollo de medidas eficaces para mejorar el rendimiento de las ostras. cultura.